福建南平社保基数11900元与5000元的主要区别在于缴费金额、个人账户积累以及退休后养老金的高低。具体来说：

1. 缴费金额差异
   社保缴费金额的计算公式为“缴费基数×社保比例”。以养老保险为例，单位和个人分别承担不同比例的费用。假设养老保险单位缴费比例为16%，个人缴费比例为8%，则缴费基数为11900元时，每月单位需缴纳1904元，个人需缴纳952元；而基数为5000元时，单位需缴纳832元，个人需缴纳400元。基数越高，企业和个人的缴费金额均会显著增加。

2. 个人账户积累差异
   个人账户养老金的计算公式为“个人账户累计储存额÷计发月数”。基数越高，每年进入个人账户的资金越多，退休后个人账户养老金也会相应提高。例如，基数为11900元时，个人账户每年的积累额会远高于基数为5000元的情况，这直接决定了退休后养老金的高低。

3. 退休后养老金差异
   养老金由基础养老金和个人账户养老金组成。基础养老金的计算公式为“（计发基数+本人平均缴费指数）÷2×累计缴费年限×1%”。基数较高的职工，其基础养老金也会更高。由于个人账户养老金的增加，整体养老金水平也会显著提升。

4. 企业负担差异
   对于企业而言，社保缴费基数越高，其负担也越大。虽然高基数有助于员工享受更好的社保待遇，但也会增加企业的运营成本。企业在选择社保缴费基数时需要综合考虑员工福利和自身经济能力。

5. 政策调整与灵活性
   南平市每年根据当地经济发展水平和社会平均工资调整社保缴费基数上下限。职工可以根据自身收入情况选择合适的缴费档次，但需注意最低和最高限额的规定。

福建南平社保基数11900元与5000元的主要区别体现在缴费金额、个人账户积累和退休后养老金的高低上。高基数虽然能带来更好的社保待遇，但也会增加企业和个人的经济负担。在选择社保缴费基数时，需根据实际情况权衡利弊，并结合政策规定合理规划。