根据2024年最新个人所得税计算方法，黑龙江佳木斯社保基数为6400元时，扣除社保后的实际到手金额及税额如下：

一、基础计算

1. 应纳税所得额

   计算公式： $$应纳税所得额 = 工资收入 - 起征点（5000元）$$
   $$应纳税所得额 = 6400元 - 5000元 = 1400元$$

2. 适用税率与速算扣除数

   根据税率表，1400元属于“工资、薪金所得”中的3%税率区间，速算扣除数为0元。

3. 应纳个人所得税

   计算公式： $$应纳个人所得税 = 应纳税所得额 \times 3% - 0元$$
   $$应纳个人所得税 = 1400元 \times 3% = 42元$$

4. 实际到手金额 $$实际到手金额 = 工资收入 - 应纳个税$$
   $$实际到手金额 = 6400元 - 42元 = 6358元$$

二、专项扣除的影响

若存在专项扣除（如五险一金、专项附加扣除等），需在应纳税所得额中进一步扣除： $$应纳税所得额 = 6400元 - 5000元 - 专项扣除金额$$

示例 ：若专项扣除为2000元（含社保）
$$应纳税所得额 = 6400元 - 5000元 - 2000元 = -700元$$

此时无需缴税，实际到手金额为6400元。

三、注意事项

1. 社保缴费基数

   6400元为税前工资，需扣除五险一金后才是应纳税所得额。不同城市社保缴费比例可能不同，建议咨询当地社保部门获取准确数据。

2. 年度汇算清缴

   若全年综合所得需补税，可在次年3月1日至6月30日通过个税APP或税务局办理汇算清缴。

以上计算基于2024年税法，未来政策调整可能影响实际税负。