新农合医保卡使用流程可分为门诊、住院及特殊病种报销等环节，具体如下：

一、门诊报销流程

1. 本乡镇内门诊

   在乡镇卫生院或村卫生所就诊时，直接使用医保卡刷卡结算，超出家庭账户总额部分由患者自付。

2. 本乡镇外门诊

   • 需先自费结算，凭发票到乡镇农医所提交报销联处方及医药发票申请报销。

   • 若在区级定点医院就诊，直接在窗口刷卡结算。

二、住院报销流程

1. 乡镇卫生院住院

   出院后7日内提交住院发票、费用清单、出院小结等材料至乡镇合管所申请报销。

2. 区级定点医院住院

   出院后直接在合作医疗直报窗口提交所有材料申请报销。

3. 转院管理

   需在7日内向乡镇农医所报备转院信息，转出地医保需配合提供转诊备案手续。

三、特殊病种门诊报销流程

需持二级及以上定点医疗机构出具的病历、检查报告及《新型农村合作医疗特殊病种门诊治疗审批表》向新农合业务管理中心申请，审核通过后按门诊报销流程执行。

四、其他注意事项

1. 激活与挂失

   首次使用前需在指定银行激活医保卡，挂失后需解除挂失才能使用。

2. 费用垫付与结算

   • 市内就诊直接刷卡结算，市外就诊需先自费后报销。

   • 住院费用由医院垫付，出院后统一结算。

3. 材料提交时效

   市外报销需在出院后3个月内提交材料，逾期可能影响报销。

建议就诊前主动告知医生参保信息，选择合规医疗机构以保障报销权益。具体政策可能因地区存在差异，建议咨询当地医保部门确认。