根据甘肃省及国家相关政策的综合说明，新生儿参加新型农村合作医疗（新农合）的生效时间需根据参保时间确定，具体如下：

一、参保时间与生效时间的关系

1. 出生即参保立即生效

   若新生儿在出生后90天（含）内完成参保缴费手续，自出生之日起即可享受新农合待遇。

2. 超过90天未参保的生效时间

   • 若超过90天但未满1年参保，保险次月（即出生后第13个月）生效。

   • 若超过1年参保，保险次年1月1日生效。

二、关键时间节点说明

• 缴费截止时间 ：甘肃省要求2025年新生儿需在出生90天（含）内完成参保缴费，而全国大部分地区新农合缴费周期为每年11月-12月，次年1月1日生效。

• 报销生效时间 ：无论参保时间，医疗费用报销均从次年1月1日起生效。

三、特殊情况处理

• 缴费后观察期 ：若参保时间跨年且存在间断，次年1-6月可能为观察期，期间产生的医疗费用不予报销。

• 材料要求 ：报销时需提供完整门诊医疗费清单（含单价与数量）。

四、法律依据

• 《中华人民共和国社会保险法》第二十四条、第二十六条等条款规定了新农合的参保范围和待遇标准。

建议 ：监护人需关注当地医保部门发布的缴费通知，确保在新生儿出生后90天内完成参保登记并缴费，以保障其医疗保障权益。