南京市医保卡丢失后的补办流程如下：

一、挂失方式

1. 电话挂失

   拨打医保服务热线 12333 或 86590922 ，提供参保人姓名、身份证号码、医保卡卡号及单位名称等信息完成挂失。电话挂失后，社会保障和银行账户挂失即时生效，电子钱包需1年后生效。

2. 书面挂失

   携带本人有效证件（如身份证、户口簿）到 社保经办机构 （如市民卡服务中心、街道社保机构）办理书面挂失手续。部分机构需填写《南京市社会保障卡业务办理单》，并缴纳30元工本费。

二、补卡流程

1. 个人办理

   • 携带身份证、户口簿等有效证件到指定社保机构办理补卡手续。

   • 补卡后，原医保卡内金额自动转入新卡，无需办理清户。

2. 单位代办

   • 单位需及时报告丢失情况，并到参保人员所在区县外管所办理补卡手续。

   • 被委托人需携带授权委托书、双方有效证件及《申请单》办理。

三、注意事项

1. 挂失时效

   • 电话挂失后需在3个工作日内办理书面挂失，否则社会保障功能将自动解除。

   • 银行账户挂失按银行规定办理。

2. 补卡时间

   • 个人办理一般需 45个工作日 领到新卡，委托他人办理需额外提供代办授权。

3. 费用与材料

   • 书面挂失需缴纳30元工本费，补卡时无需额外费用。

4. 特殊情况处理

   • 若补卡期间找到原卡，可携带原卡与新卡到医保中心解挂。

四、法律依据

补卡流程依据《中华人民共和国社会保险法》相关规定执行，确保参保人员权益不受影响。

建议办理前通过南京医保官方APP或12333平台确认最新流程，避免遗漏材料或跑空。