根据南京市医疗保障局的相关政策，异地医保参保人可以在南京办理门诊特殊病种（门特）相关手续，具体流程和注意事项如下：

一、办理条件

需符合南京市门诊特殊病种认定标准，如高血压、糖尿病、恶性肿瘤等20余种疾病。

二、办理材料

需提供南京市定点医疗机构出具的《门诊特殊病种认定申请表》、诊断证明、病历资料、费用明细等材料。

三、办理流程

1. 线上办理

   通过“南京医保”微信公众号或“我的南京”APP的“异地门诊专项病种登记备案”模块提交材料（需拍照上传）。

2. 线下办理

   直接到南京市医保经办机构或定点医疗机构办理。

四、待遇享受

• 门诊费用报销 ：经认定后，参保人可选择3家定点医疗机构及1家定点零售药店享受门诊特殊病种待遇，慢性肾功能衰竭透析治疗、血友病等5种疾病限选1家。

• 异地就医支持 ：已办理异地就医确认手续的参保人，可在南京的定点医疗机构直接结算门诊费用，按南京医保政策报销。

五、注意事项

1. 异地就医确认 ：需先在参保地办理异地就医备案手续，未备案无法直接结算。

2. 定点机构选择 ：部分病种（如慢性肾衰竭透析）限选1家定点医疗机构，其他病种可选择多家。

3. 政策调整 ：异地就医直接结算范围已扩大至城乡居民医保，门诊特殊病种也纳入直接结算范围。

建议办理前通过南京市医疗保障局官网或“南京医保”公众号确认最新政策，以确保流程顺利。