医保缴费不会直接从社保卡里扣除，具体说明如下：

一、缴费渠道与账户结构

1. 缴费主体与账户划分

   医疗保险缴费分为个人缴费和单位缴费两部分：

   • 个人缴费 ：进入参保人员个人账户，用于支付门诊自付部分、药店购药等小额费用；

   • 单位缴费 ：进入社会医疗统筹基金，用于支付住院、大额医疗费用等。

2. 社保卡的功能差异

   社保卡是参保人员身份识别和医疗费用结算的凭证，但仅限医保功能，不直接存储单位缴费部分。单位缴费部分由医保中心统一管理，个人无法直接操作。

二、自动扣款机制

1. 代扣条件

   若参保人员与社保经办机构签订了代扣协议，且社保卡绑定了代扣银行，每月医保费用会自动从绑定的银行卡中扣除。

2. 账户余额与扣款关系

   • 社保卡内仅存储个人账户资金，单位缴费部分不进入社保卡；

   • 即使社保卡内有个人账户余额，医保费用仍需单独划入，不会因卡内有钱而自动扣除。

三、特殊情况说明

• 灵活就业人员 ：若通过银行代扣，需在银行关联医保账户；若未关联，则需手动缴费；

• 账户查询 ：银行柜台查询的卡内余额可能不显示医保缴费记录，需通过社保机构查询。

四、注意事项

1. 避免账户混淆 ：医保卡内无单位缴费部分，若发现异常扣款，需及时联系银行或社保机构；

2. 及时缴费 ：若未按时缴费，医保待遇可能中断，建议每月固定时间存入社保卡或银行卡。

医保缴费不会直接从社保卡扣除，需通过银行代扣（需签约）或手动缴费，且社保卡仅用于个人账户资金结算。