关于农民大病二次报销的报销部门，需根据具体情况判断：

一、报销部门划分

1. 医保局主导的二次报销

   多数地区的二次报销已由医保局统一管理，需通过当地医保局或新农合结算窗口办理。患者需携带身份证、医疗费用清单、出院小结等材料。

2. 民政部门主导的专项补助

   部分地区的二次报销（如大病困难补助）仍由民政部门负责，需向民政办公室或乡镇民政所申请。例如：

   • 河北省：低保五保孤儿失独患者无最低金额限制，合规自付金额按100%报销；普通患者自付金额超过3万元的部分按60%报销。

二、报销流程要点

1. 材料准备

   • 住院报销：身份证、医疗费用清单、出院小结、住院发票等。

   • 门诊报销：门诊发票、合作医疗证历本、特殊病种建议书等。

2. 报销比例与限制

   • 一般患者：自付金额超过3万元部分按60%报销。

   • 特殊群体：低保五保孤儿失独按100%报销，其他群体按80%报销。

3. 办理地点

   • 市社保中心、乡镇农村合作医疗办公室或村委会。

三、注意事项

• 具体政策因地区而异，建议提前咨询当地医保局或乡镇部门，确认报销比例、材料要求及办理流程。

• 部分地区支持异地就医直接结算，需提前备案。

如需进一步确认，可拨打当地医保热线（如12333）咨询。