跨省新农合报销流程可分为以下步骤，综合多个权威信息源整理如下：

一、备案登记（关键环节）

1. 线上备案

   通过"国家异地就医备案"小程序办理，或持身份证、参合证到县合管办现场登记。

2. 急诊备案

   突发疾病可先就医，入院后3日内电话报备（需保留通话记录）。

3. 备案时效

   转诊单有效期3个月，超期需重新申请。

二、选择定点医院

1. 登录"国家医保服务平台"查询跨省联网定点机构，优先选择直接结算医院（结算时自动扣除报销部分）。

三、住院登记与费用管理

1. 住院手续

   出示身份证、新农合医疗证办理入院，主动告知已备案信息。

2. 费用清单管理

   每日核对费用明细，要求医院提供用药清单、检查项目明细及特殊治疗说明（如进口器械使用）。

四、出院材料收集与报销申请

1. 必备材料

   • 住院发票（原件）

   • 费用总清单

   • 出院小结/诊断证明

   • 转诊备案手续

   • 补充材料：急诊证明（未备案者）、务工单位证明（外出人员）。

2. 提交与结算

   • 直接结算 ：开通跨省直结的医院直接抵扣报销部分。

   • 回参合地报销 ：携带材料到县合管办，15个工作日内完成审核。

五、特殊情况说明

• 代理申请 ：患者本人不能办理时，由配偶、父母、子女代申请；无亲属的，由村民委员会负责人代办。

• 材料审核 ：县级以下定点医疗机构负责审核材料，材料齐全当场受理，有疑问则移交核实。

六、法律依据

报销流程依据《国务院办公厅转发卫生部等部门关于建立新型农村合作医疗制度意见的通知》及《中华人民共和国社会保险法》等法律法规执行。

注意事项 ：不同地区可能存在细微差异，建议提前电话咨询参合地经办机构确认具体流程及材料要求。