根据您描述的情况，医保缴费3个月但账户余额为零，可能由以下原因导致：

一、参保类型问题

1. 城乡居民医疗保险

   若您缴纳的是城乡居民医保（按年缴费），则个人账户不设立，所有费用直接进入统筹基金，个人账户自然无余额。

2. 灵活就业人员低档参保

   部分地区灵活就业人员若选择低缴费档次（如4%），个人账户不建立，因此无余额。

二、缴费状态异常

1. 缴费未成功或中断

   若存在缴费延迟、欠费或系统故障，可能导致账户未正常建立或资金未汇入。需检查缴费记录或联系单位确认。

2. 银行账户问题

   社保卡绑定的银行账户异常（如冻结、注销）可能导致资金无法存入。需核实银行账户状态。

三、个人信息不一致

若参保人姓名、身份证号等个人信息与医保卡信息不匹配，可能导致账户无法正常关联，需及时到社保部门或银行办理信息变更。

四、其他特殊情况

• 地区政策差异 ：如深圳市职工医保二档及居民医保均不设个人账户，需确认当地医保政策。

• 退休人员待遇 ：灵活就业人员退休前不享受个人账户待遇，但退休后可能恢复。

建议处理步骤

1. 核对参保类型 ：确认是否为职工医保一档（有个人账户）或城乡居民医保/灵活就业低档（无个人账户）。

2. 检查缴费记录 ：通过社保平台或单位确认近3个月缴费是否成功。

3. 激活社保卡 ：若为实体卡，确认银行账户激活且资金已汇入。

4. 修改个人信息 ：若信息不一致，携带证明材料到社保窗口办理变更。

若以上步骤仍无法解决，建议联系当地医保经办机构（如深圳市医疗保障经办机构）进一步咨询。