根据我国医疗保障体系的相关法律规定和政策，员工在公司缴纳社保后，通常无需再缴纳农村合作医疗（新农合）。以下是具体说明：
一、社保与农合的保障范围差异
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社保（职工医保）
覆盖城市职工及灵活就业人员，由用人单位和职工共同缴纳，属于强制参保项目。其报销比例较高，例如门诊报销60%、住院报销较高比例等。
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农合（新型农村合作医疗）
主要覆盖农村居民，与户籍或居住地相关，属于自愿参保项目。其报销比例较低（如门诊约20%、住院约20%-30%），且存在年度最高报销限额。
二、重复参保的法律规定
根据《社会保险法》第二十三条规定，职工应当参加职工基本医疗保险，不得同时参加其他医疗保障制度。若已通过职工医保获得医疗保障，则无需再参加农合，否则属于重复参保，需退回多缴费用。
三、特殊情况说明
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户籍仍为农村的职工
若职工户籍仍为农村，但已由单位缴纳职工医保，则无需再缴纳农合。若职工主动要求保留农合资格，需咨询当地医保部门确认是否允许。
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灵活就业人员
无雇工的个体工商户、未参加职工医保的非全日制从业人员等灵活就业人员，若未参加职工医保，则需根据实际情况选择参保方式（如参加职工医保或农合）。
四、建议
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优先选择职工医保 ：若已就业且单位依法缴纳社保，建议停止缴纳农合，以享受更高保障。
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确认参保状态 ：可通过当地医保部门或单位人事部门确认参保情况，避免因政策调整或信息差异遗漏参保。
在公司缴纳社保后无需再缴纳农合，但需注意户籍状态及自身参保资格。
