阿坝州州府设在马尔康市，而非阿坝县，原因主要在于历史沿革、地理位置、经济条件以及政策考量。

历史背景

马尔康作为阿坝州的州府，有着深厚的历史渊源。1955年阿坝藏族自治州成立时，州府最初设在刷经寺，1958年迁至马尔康，此后一直沿用至今。这一选择体现了对历史传统的延续。

地理优势

马尔康地处川西北交通枢纽，是阿坝州的政治、文化、金融和信息中心，同时也是川西北地区的贸易中心。其地理位置优越，交通便利，与州内其他地区及外部的联系更加紧密。相比之下，阿坝县位于四川、甘肃、青海三省交界处，交通条件相对不便，不适合作为州府所在地。

经济考量

马尔康拥有较好的基础设施和自然条件，经济发展水平较高，是阿坝州经济较为发达的地区之一。其作为州府，能够更好地带动全州经济协调发展。而阿坝县经济发展相对滞后，作为州府的潜力有限。

政策因素

州府的设置还与政策考量密切相关。马尔康作为川西北的交通、贸易和文化中心，其发展符合州政府推动区域协调发展的战略目标。马尔康的历史文化底蕴和自然资源也为州府所在地提供了更多发展优势。

总结

阿坝州州府设在马尔康市而非阿坝县，是基于历史、地理、经济和政策等多重因素的综合考量。这一选择不仅符合阿坝州的发展需求，也体现了对区域协调发展和历史文化的尊重。