公司缴纳医保但个人账户余额为0，可能由以下原因导致，需结合具体情况排查：

一、个人账户未划入

1. 新参保未完成初始缴费

   新入职员工需完成3个月及以上的缴费后，个人账户才会开始划入资金。

2. 缴费档次问题

   若参保人员所在城市实行分档缴费（如深圳第二、三档），仅一档参保才有个人账户，二三档无个人账户。

二、灵活就业人员参保

灵活就业人员通常以单位名义缴纳社保，但个人账户可能未设立（尤其低缴费档次），导致余额为0。

三、查询方式错误

1. 混淆社保卡账户类型

   社保卡含金融账户和个人账户，ATM机仅显示金融账户余额，需通过医保定点机构或官网查询个人账户。

2. 系统延迟或工具错误

   部分情况下，系统延迟可能导致账户未及时更新，或使用非官方渠道查询出现错误。

四、其他特殊情况

1. 账户冻结或欠费

   若个人银行账户被冻结或医保账户欠费，可能影响个人账户资金到账。

2. 单位缴费问题

   单位未按时足额缴费、社保卡未激活或系统故障，可能导致账户无余额。

解决建议

1. 核对缴费状态

   通过单位或社保部门确认是否已按时缴费，检查缴费档次是否正确。

2. 检查账户类型

   确认是否为职工医保（有个人账户）或城乡居民医保（无个人账户），灵活就业人员需关注当地政策。

3. 正确查询方式

   使用医保官方APP或线下渠道查询，避免混淆金融账户与个人账户。

4. 关注账户变动

   定期查看银行短信或医保平台，确认是否有家庭共济支出或补贴扣除。

若以上方法仍无法解决，建议联系单位人事部门或当地社保机构进一步核查。