根据江苏省医保政策，南通医保在连云港的使用情况如下：

一、异地就医备案后的使用规则

1. 备案后本地就医无影响

   南通市基本医疗保险参保人员办理异地就医备案后，原选定的南通市个人定点医院保持不变，允许在南通市和就医地（如连云港）双向享受医保待遇。

2. 药店购药限制

   • 门诊购药 ：需在就医地（连云港）的定点药店购药，无法直接使用南通医保。需通过就医地医保系统结算，可能需要提供南通的医保凭证。

   • 特殊药品/材料 ：部分特殊药品或材料可能受限于医保目录，需提前确认是否在连云港的报销范围内。

二、其他注意事项

• 社保转移的影响 ：若社保未转移至南通，需在南通重新参保并完成异地就医备案，否则可能影响待遇享受。

• 系统差异问题 ：不同城市医保系统存在差异，可能导致部分功能（如直接刷卡）无法使用，但备案后仍可享受报销待遇。

三、建议操作步骤

1. 办理异地就医备案 ：通过江苏医保官方平台或线下医保机构办理备案，选择连云港为就医地。

2. 确认用药范围 ：提前电话咨询连云港定点药店，确认所需药品是否在医保报销目录内。

3. 保留就医凭证 ：异地就医时需携带医保卡、身份证及备案证明，确保顺利结算。

若遇到具体操作问题，建议拨打江苏医保热线12333咨询最新政策。