基因突变是否会被清除取决于突变的性质和位置，以下是具体分析：

一、无法清除的基因突变

1. 永久性改变

   基因突变是DNA序列的永久性改变，一旦发生通常无法自行修复。细胞缺乏直接逆转突变的能力，且多数情况下不会通过自然机制恢复原始基因状态。

2. 致病基因突变

   多数致病基因突变（如导致遗传病的突变）会持续存在并可能遗传给后代。例如囊性纤维化、镰状细胞贫血等，目前医学手段无法完全清除这些突变。

二、可能被调控或缓解的基因突变

1. 细胞自我修复机制

   部分基因突变可通过细胞内的DNA修复机制（如错配修复、非同源末端连接）进行修复，但成功率有限且可能伴随新突变。

2. 基因编辑技术

   通过CRISPR等基因编辑技术，理论上可以修正特定基因突变。但该技术目前存在修复效率低、脱靶风险等局限性，且无法改变已遗传给后代的突变。

3. 疾病相关突变的动态变化

   • 癌症基因突变 ：部分癌症（如非小细胞肺癌）的基因突变在靶向治疗作用下可能暂时缓解，但突变本身不会完全消失，且可能复发。

   • 病毒基因突变 ：如新冠病毒，其RNA聚合酶纠错能力差，导致突变基因无法被清除，从而产生持续变异。

三、特殊情况的补充说明

• 隐性基因突变 ：若突变发生在隐性基因且未表达相关功能，可能不会引发临床症状，但也不会被清除。

• 基因冗余性 ：多基因系统中的冗余基因可能补偿单一基因的功能缺失，从而避免疾病表现。

总结

基因突变大多无法被清除，但可通过医疗手段调控或缓解其影响。对于致病性突变，目前仍需依赖药物、手术等综合治疗，而完全清除突变基因仍属科研难题。