往来账未及时清理主要违反以下规定：

一、行政单位相关财务规定

1. 《行政单位财务规则》

• 第29条 ：行政单位需严格控制暂付款规模，并及时清理结算，禁止长期挂账。

• 第36条 ：暂存款项应纳入单位收入管理，需及时清理结算，不得长期挂账。

2. 《部门决算管理办法》

• 第十二条 ：要求单位全面清理收入、支出，核对预算收支与缴拨款项，被审计单位若存在往来款管理问题（如长期挂账、核算不规范），将影响决算准确性。

二、事业单位相关财务规定

1. 《事业单位会计准则（试行）》

• 第30条 ：应付款项和应缴款项应及时清理结算，不得长期挂账。

• 第23条 ：应收及预付款项需定期与债务人对账，及时清算催收。

三、其他相关规范

• 《会计法》 ：要求单位依法设置账簿，保证真实完整。长期未记账（如收到款项未入账）可能涉及截留、挪用资金等违法行为。

• 《税收征收管理法》 ：企业需按月申报纳税，长期不申报或虚报收入会导致罚款、列入非正常户等后果。

四、其他注意事项

• 税务处理 ：往来账龄超过3年且无法收回的款项，企业可按会计准则确认为坏账损失，但需说明原因并出具专项报告。

• 责任追究 ：未及时清理往来账可能导致领导责任、制度缺陷等，甚至引发审计处罚。

建议相关单位立即开展往来账清理工作，规范财务核算，防范财务风险。