增值税纳税申报表附表二填写指南如下：
一、基本填写规范
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税款所属时间
填写申报的增值税应纳税额所属时间，需精确到年、月。
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纳税人名称
填写单位全称并加盖公章。
二、分栏填写说明
（一）认证相符的增值税专用发票（第1-3栏）
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第1栏 ：本期申报抵扣的认证相符发票，需包含红字发票。
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第2栏 ：本期认证且申报抵扣的发票数据。
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第3栏 ：前期认证相符且本期申报抵扣的发票数据。
（二）非防伪税控增值税专用发票及其他扣税凭证（第4栏）
- 填写本期申报抵扣的非防伪税控发票、海关进口增值税专用缴款书、农产品收购发票等。
（三）进项税额明细（第5-10栏）
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第5栏 ：本期认证相符的运输费用结算单据。
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第6栏 ：本期认证相符的海关进口增值税专用缴款书。
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第8栏 ：本期未认证的运输费用结算单据。
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其他项目需根据实际业务类型填写。
（四）期初已征税款（第11栏）
- 填写本期申报抵扣的初期存货挂账税额。
三、注意事项
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销售额与进项税额匹配
报表金额需为含税金额，农产品收购发票等特殊项目需注意税额抵扣规则，确保“报表金额 - 可抵扣税额 = 账面金额”。
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辅助表格的关联
需同时附列《增值税专用发票/收购凭证/运输发票抵扣明细表》等。
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不同纳税人类型差异
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一般纳税人：需填写全部栏次，商贸企业辅导期无需填写第23-25栏。
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小规模纳税人：仅需填写销售额、进项税额和应纳税额。
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四、特殊情况处理
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工程类进项 ：需单独做进项税额转出。
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差额扣除项目 ：需在附列资料（一）中填报差额信息。
建议填写完成后仔细核对，确保数据一致性。若遇复杂业务，可咨询税务机关或专业机构。
