在四川阿坝地区，有几家医院在治疗尿中有蛋白（蛋白尿）方面具有良好的口碑和专业能力。以下是一些推荐的医院：

1. 四川大学华西医院：华西医院是西南区肾脏科医院排行榜第1位，拥有强大的医疗团队和先进的医疗设备，提供高质量的肾脏疾病治疗服务。

2. 四川省医学科学院·四川省人民医院：这家医院在西南区肾脏科医院排行榜第2位，设有肾脏内科，专门处理包括蛋白尿在内的各种肾脏疾病。

3. 阿坝州人民医院：作为阿坝地区的综合性医院，阿坝州人民医院设有肾脏内科，擅长治疗包括高血压肾病在内的多种肾脏疾病。

4. 阿坝藏族羌族自治州中医院：这是一家三级甲等中医医院，设有心血管内科，在高血压肾病方面具有一定的优势。

5. 阿坝州第二人民医院：作为一家二级甲等综合医院，阿坝州第二人民医院设有肾脏内科，能够满足高血压肾病患者的就医需求。

6. 四川省阿坝州金川县人民医院：这家县级公立医院设有内科科室，可以对高血压肾病进行诊治。

7. 四川省阿坝州红原县人民医院：作为该县唯一的县级公立医疗机构，设有内科门诊，可处理高血压肾病相关问题。

请注意，以上信息仅供参考，具体治疗方案应根据个人病情和医生的建议确定。如果您或您的家人需要治疗尿中有蛋白的问题，建议尽快联系上述医院的相关科室进行详细检查和治疗。