合作医疗报销的钱款发放方式需根据参保类型和地区政策具体分析，主要分为以下几种情况：

一、直接打入社保卡

1. 社保卡激活状态正常

   若参保人持有激活的社保卡，报销费用通常会直接打入该卡内，参保人可通过社保卡查询报销明细并用于后续医疗费用结算。

2. 异地就医直接结算

   部分城市支持异地就医直接结算，报销款项可直接转入参保人指定的社保卡或银行卡，具体需根据就医地政策确认。

二、其他支付方式

1. 银行账户

   若参保人未办理社保卡或社保卡无法使用，报销费用可能通过银行转账方式支付，需提供参保人身份证号、银行卡号等材料。

2. 新农合一卡通

   在部分地区（如江西），新农合报销费用会打入“新农合一卡通”，适用于参加新型农村合作医疗的农户。

三、特殊情况处理

1. 二次报销

   若符合“二次报销”条件（如大病救助），报销金额可能分阶段发放，需经审核后再次打入账户。

2. 手工结算

   少数情况下，若系统延迟或材料审核不通过，可能需通过乡镇合管所手工结算。

四、注意事项

• 报销材料需在出院后及时提交（如发票、费用清单等），逾期可能影响结算；

• 不同地区政策存在差异，建议提前咨询当地医保机构，尤其是异地就医和门诊报销流程。

综上，合作医疗报销资金主要发放至社保卡或银行卡，具体以参保类型和地区规定为准。