当发票金额正确但数量开少时，需根据具体情况选择合规的处理方式：

一、正确处理方式

1. 作废原发票并重新开具

   若发票已开具且未超过180天，需作废原发票后重新开具正确数量的发票。这是增值税发票管理的规范要求，可避免后续税务风险。

2. 补开发票补足差额

   若发票未超过180天，也可选择补开发票补足差额，但需同时提供原发票及补开发票的真实性证明。

二、注意事项

• 发票作废条件

  增值税普通发票需在开具30日内作废，专用发票需在开具360日内作废。若超过期限，需通过红字发票冲销后重新开具。

• 避免违规操作

  直接修改发票内容（如拆分发票）属于违规行为，可能导致税务处罚。

• 合同条款约定

  若合同对数量调整有明确条款，需按合同约定处理，部分情况下可能允许协商调整。

三、补充说明

• 数量与金额匹配原则

  发票应同时满足“数量、金额匹配”的原则，若数量异常减少且无法合理解释，可能涉及虚开发票风险。

• 税务风险防范

  建议在开票前与客户确认商品信息，避免因信息误差引发纠纷。若已开具错误发票，应尽早处理，减少潜在税务风险。

综上，最合规的处理方式是作废原发票并重新开具正确发票，若涉及跨期或特殊情形，需结合税务机关要求制定解决方案。