武汉中南医院有多个科室在医疗领域具有较高的知名度和影响力，以下是一些比较有名的科室：
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重症医学科
- 是卫生部首批国家临床重点专科，诊疗水平位居全国第一梯队。承担着医院最危重患者的救治工作，在救治严重休克、急性呼吸衰竭、急性肾衰竭、多器官功能障碍综合征、严重创伤、复杂感染、心跳骤停后综合征等方面有着丰富的经验，抢救效果居于国内领先水平。
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变态反应科
- 作为湖北地区第二家独立成科的专门治疗过敏性疾病的临床科室，其专科疾病谱覆盖呼吸道过敏、皮肤过敏、药物过敏、食物过敏以及严重过敏反应等多方面，医疗服务水平位于国内专科前列。
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精神科
- 是我国综合医院中首家设立的神经学科与心理学科交叉、融合的临床专科。本学科是国家级核心高级认知障碍诊疗中心、心身医学诊疗中心；神经科医生与心理科医生组成多学科团队协作诊疗模式，重视对躯体与心理状态的全面评估与综合治疗，为全省医疗机构提供神经心理疑难疾病的会诊服务。
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心血管外科
- 是武汉大学重点建设学科，现已成为立足湖北、辐射全国，集医疗、科研、教学为一体的大型心血管外科中心。拥有目前国际最先进的第四代“达芬奇”机器人手术系统和湖北省内最大的心血管外科杂交手术室，为心脏重症及移植患者生命护航。
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病理科
- 在省内率先开展了免疫组化检测、荧光原位杂交、PCR、DNA测序等技术，使病理诊断精确到分子水平，更好地指导临床治疗，得到了业内高度认可。
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中医科（中西医结合科）
- 是集临床、科研、教学于一体的专业科室，系全国综合医院中医科示范单位、湖北省内分泌重点专科，湖北省中西医结合肿瘤专业主委单位，配备有国家级中医内分泌分子实验室(三级），承担武汉大学第二临床...
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泌尿外科
- 是国家级临床重点专科，在泌尿系统疾病的诊断和治疗方面有着较高的水平和丰富的经验。
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妇科肿瘤科
- 也是国家级临床重点专科，专注于妇科肿瘤的诊断、治疗及研究，在妇科肿瘤的综合治疗方面具有显著优势。
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结直肠肛门外科
- 同样是国家级临床重点专科，对于结直肠肛门相关的疾病能够提供专业的诊断和治疗方案。
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血液内科
- 作为国家级临床重点建设专科，在血液系统疾病的诊断、治疗及研究方面有着深厚的造诣。
武汉中南医院的这些科室凭借其卓越的医疗技术、雄厚的师资力量和先进的医疗设备，在各自领域内取得了显著成就，为患者提供了高质量的医疗服务，也为医院的声誉和发展做出了重要贡献。
