工程审计费用是企业在进行工程项目时需要支付给审计机构的服务费用。了解1000万元工程审计费用的具体数额，需要考虑多个因素，包括审计费用的标准、计算方法以及市场行情等。

工程审计费用标准

基本审计费

• ​标准计费方法：基本审计费通常按单项工程总投资额的一定比例计取。例如，送审工程造价在100万元以下的部分按2‰支付，100万元以上至500万元以下的部分按1.92‰支付，500万元以上至1000万元以下的部分按1.84‰支付，1000万元以上至5000万元以下的部分按1.76‰支付，5000万元以上至10000万元以下的部分按1.6‰支付，10000万元以上至30000万元以下的部分按1.4‰支付。
• ​具体费用计算：对于1000万元的工程，基本审计费为1000万元×1.84‰=1.84万元。

审减（增）额审计费

审减（增）额审计费按审减（增）额减允许额的余额计取。例如，如果审减额为30万元，其中允许差额为5万元，审减余额为25万元，则审减（增）额审计费为25万元×5%=1.25万元。

影响审计费用的因素

工程规模和复杂程度

• ​规模和复杂度：工程的规模和复杂程度直接影响审计工作的难度和工作量。大型、复杂的工程需要更多的审计资源和时间，收费标准自然较高。
• ​设计工作量：如果只委托初步设计或施工图设计，按行业划分设计工作量各占的比例并乘以1.1的系数计算收费。如果增加编制施工图预算，则按工程设计收费标准乘以1.1系数计算收费。

审计机构的资质和水平

具有高资质、高水平审计机构的收费标准通常较高，但其提供的审计报告质量更高，风险更低。

地区差异

不同地区的经济发展水平、消费水平和市场行情不同，导致工程审计报告的收费标准存在地区差异。

审计费用的计算方法

按工程造价比例计算

工程审计费可以按照工程造价的一定比例收取，这个比例通常在0.1%到0.5%之间不等。

按审计工作量计算

审计费用也可以根据审计师的工作量来计算，包括审计师的工作时间、人力、材料等费用。

综合因素计算

工程审计的费用计算通常还会考虑工程规模和复杂程度、审计时间和工作量、审计机构和专业人员的费率以及其他额外费用。

1000万元的工程审计费用大致在1.84万元的基本审计费和1.25万元的审减（增）额审计费之间，总计约为3.09万元。具体费用还会受到工程规模、复杂程度、审计机构资质、地区差异等多种因素的影响。审计费用的计算方法通常包括按工程造价比例计算、按审计工作量计算以及综合因素计算。