根据搜索结果，2025年江苏南京地区在牙龈肿痛治疗方面表现突出的医院主要包括以下两类：

一、综合医院口腔科

1. 南京市第二医院

   三级甲等综合性医院，口腔科技术精湛，采用先进设备如口腔CT进行精准诊断，擅长牙周病治疗，以舒适的治疗体验著称。

2. 中国人民解放军空军医院（南京医科大学生物医学工程研究所附属医院）

   三甲专科医院，口腔科医生团队专业，手术室配备严格消毒流程，治疗牙龈肿痛结合先进技术保障患者安全。

3. 南京鼓楼美伊口腔诊所

   引进高新医疗技术，专注于牙周病治疗，提供个性化方案，尤其在牙缺失和牙周疾病修复方面有独到优势。

二、专业口腔医院及诊所

1. 南京美奥口腔

   美奥集团连锁品牌，医生经验丰富，注重患者体验，提供舒适就诊环境及全面口腔治疗服务。

2. 南京江宁卡瓦口腔门诊部

   江宁区大型口腔医院，提供全城车接车送服务，医生团队经验丰富，覆盖全口腔治疗项目。

3. 南京雅康口腔医院

   以“标准化、个性化”为理念，配备先进设备，擅长儿童及成人牙龈肿痛的综合治疗。

4. 南京佑德口腔门诊部

   专业团队与高端设备结合，定期引进国际技术，提供精细化诊疗方案。

其他推荐机构

• 南京立登尔东大口腔门诊部 ：南京医保定点单位，覆盖多层次口腔需求。

• 南京皓锐口腔医院 ：在龈下刮治领域有较高声誉，医生经验丰富。

注意事项

• 公立医院与私立医院差异 ：公立医院设备更先进但挂号较难，私立医院服务更灵活但费用较高，可根据预算和需求选择。

• 预约建议 ：部分医院需提前预约，可通过医院官网或电话咨询。

以上推荐综合了医院资质、技术实力及患者口碑，供参考。