深圳灵活就业社保之所以较低，主要原因可以归纳为以下几点：

1. 经济发展水平较高 ：深圳作为中国的一线城市，经济发展迅速，人均收入较高，因此社保缴费基数相对较低。

2. 劳动力市场竞争激烈 ：深圳吸引了大量人才，为了吸引和留住人才，政府可能会通过降低社保缴费负担来提高人才的福利待遇。

3. 社保政策差异 ：不同地区的社会保障政策存在差异，深圳的社会保障政策可能相对较为完善，导致缴费水平较低。

4. 缴费基数较低 ：深圳灵活就业社保的缴纳基数是根据当地上一年度的月平均工资来确定的，最低基数大约为每月3500元左右，这直接影响了社保费用的高低。

5. 按最低工资标准缴纳 ：深圳的社保缴费基数是按当地最低工资2200元为基准，而不是按实际到手工资为基数，这也是导致社保费用较低的一个重要原因。

6. 养老金和医疗保险费用较低 ：由于深圳的养老保险和医疗保险缴费基数较低，这也使得整体社保费用相对较低。

7. 人口老龄化程度较低 ：深圳相对年轻化，老年人口比例较少，养老压力不大，因此养老保险缴费比例较低。

综合以上几点，深圳灵活就业社保较低的原因主要包括经济发展水平较高、劳动力市场竞争激烈、社保政策差异、缴费基数较低、按最低工资标准缴纳、养老金和医疗保险费用较低以及人口老龄化程度较低等多个方面。这些因素共同作用，使得深圳的灵活就业社保费用相对较低。