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灵活就业人员的社保扣款 通常是从其社保卡（或银行账户）中扣除的 。以下是具体的扣款方式和细节：

1. 自动扣款 ：灵活就业人员的社保费用通常是通过银行自动扣款的。参保人员需要提供自己的银行卡号，税务部门会在每月的固定日期（如20号）进行代扣代缴。扣款成功后，税务部门会通知参保人员。

2. 社保卡绑定 ：为了确保扣款顺利进行，参保人员需要将社保卡与银行账户进行绑定。这通常在办理社保卡时就已经完成，银行会自动从绑定的银行卡中扣除相应的社保费用。

3. 扣款顺序 ：如果银行卡内的余额不足以缴纳当月的社保费用，银行会按照养老保险、医疗保险、失业保险的顺序依次进行扣款。如果次月余额充足，银行会进行正常补缴。如果欠费超过3个月，银行将不会再自动扣费，参保人员需要到社保经办机构办理回盘业务，重新发送个人缴费信息给银行。

4. 金融社保卡 ：对于已经办理了金融社保卡的参保人员，社保费用会从金融社保卡账户中扣除。如果没有办理金融社保卡，参保人员可以选择提供任意一家银行的账号用于缴交社会保险费。

综上所述，灵活就业人员的社保扣款主要是从社保卡（或绑定的银行账户）中自动扣除的。参保人员需要确保社保卡（或银行账户）内有足够的余额，以便顺利缴纳社保费用。