职工医保转农村医保后， 余额是不会消失的 。以下是一些可能的原因和解决方法：

1. 未办理转移手续 ：如果你还没有按照法定流程办理医保关系的转移，那么卡内的余额可能无法正常使用。需要尽快到社保部门咨询并办理转移手续。

2. 非本人或直系亲属使用 ：医保卡内的资金只能由本人或其直系亲属使用。如果卡内资金被他人使用，可能会导致无法正常使用。需要确认使用情况，并采取相应措施。

3. 卡内信息未更新 ：职工医保转为新农合后，需要置换卡内的信息，但卡内的余额不会丢失。如果信息未更新，可能会导致使用上的不便。需要联系相关部门更新卡内信息。

4. 未激活或密码错误 ：如果个人的医保卡未能激活或密码输入错误，也会导致无法正常使用卡内资金。需要激活医保卡或更正密码。

5. 资金未成功转移 ：在医保转移过程中，个人账户余额可能没有随之转移。如果发现余额消失，可能是因为转移过程中出现了问题，需要联系原参保地或新参保地的经办机构进行详细查询和处理。

综上所述，职工医保转农村医保后，只要按照法定流程办理转移手续，并确保卡内信息正确无误，卡内的余额是可以正常使用的。如果遇到问题，建议及时联系社保部门或相关机构进行咨询和解决。