社区医院建立健康档案的目的主要包括以下几点：

1. 有效管理慢性疾病 ：健康档案的建立过程是一个疾病筛查与预防的过程，可以及早发现高血压、糖尿病等慢性疾病，从而进行早期干预和管理。

2. 改变不良生活习惯 ：通过建立健康档案，可以普及健康知识，从而改变人们不良的行为和生活习惯，提高健康水平及卫生健康质量。

3. 节约医疗开支 ：居民带着个人健康档案去医院就诊，可以给医生诊治疾病带来很大的方便，不仅为病人节约了医疗开支，还减少了病人因检查所带来的麻烦和痛苦。

4. 提供优质的卫生服务 ：建立完整、真实的健康档案，基层卫生服务工作者可以了解居民对基层卫生服务的需求，从而提供优质、综合、连续的基层卫生服务，提高辖区居民的健康水平，改善辖区卫生状况。

5. 及时发现健康隐患 ：通过管理健康档案，医生有更多的机会发现健康危险因素和病患，这有利于为辖区居民提供更好的预防保健服务。

6. 提高社区卫生服务质量和工作效率 ：健康档案可以帮助社区医护人员较全面地认识社区居民健康状况，动态掌握社区居民现存的或潜在的健康问题，从而有针对性地实施社区健康干预，提高服务质量和工作效率。

7. 为教育、科研提供基本资料 ：健康档案可以作为社区医学教学和研究的重要参考资料，为教育、科研提供基本资料。

8. 促进居民自我健康管理 ：居民可以通过健康档案了解和掌握本人健康状况的动态变化情况，增强自我健康管理意识。

综上所述，社区医院建立健康档案的目的在于全面提升社区居民的健康水平，优化医疗资源配置，提高卫生服务质量和效率，并为居民提供更加个性化、连续性的医疗保健服务。