新农合二次报销的流程如下：
- 医院直接报销 ：
- 在二甲医院或定点医院就医的新农合参保人员，可以直接在医院收费窗口由医院垫付大病保险赔付资金，出院时自动依据新农合大病保险比例来报销，无需额外办理报销手续。
- 出院后报销 ：
- 如果是在其他医院就医，需要携带诊断证明、身份证、参合证原件等材料到新农合结算科进行审核，符合条件者则可拿到新农合补偿款。
- 所需材料 ：
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新农合补偿结算单
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居民身份证患者户籍原件、参合证原件
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医疗机构费用发票，或者加盖原件收存单位公章的复印件
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费用清单、出院结算单或者盖原件收取单位公章的复印件
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持有特殊慢性病患者提供的慢性病证，或者二级以上医疗机构出具的特殊慢性病诊断证明以及门诊病历
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患者本人或者与患者有关系证明的关系人银行汇款账号。
- 时间限制 ：
- 新农合二次报销的时间限制一般为参保人结束治疗后的6个月以内，携带相关材料去相关部门进行报销即可。
- 报销金额计算 ：
- 报销金额通常根据当地政策规定，按照一定比例（如50%、55%、60%等）计算，且二次报销的资金额度有一定的限制，通常根据不同医疗机构的限额进行报销。
建议：
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尽量在定点医院就医，以便直接在医院完成二次报销结算，节省时间和精力。
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提前准备好所有必要的报销材料，确保在申请报销时能够顺利通过审核。
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关注当地新农合管理机构的最新通知和要求，以便及时了解报销政策的变化。