农村合作医疗的报销比例 根据就诊机构的不同而有所差异 ，具体如下：
- 门诊补偿 ：
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在村卫生室及村中心卫生室就诊，医疗费用可报销60%。
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在乡卫生院就诊，医疗费用可报销40%。
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在二级医院就诊，医疗费用可报销30%。
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在三级医院就诊，医疗费用可报销20%。
- 住院报销比例 ：
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在乡卫生院住院，医疗费用可报销60%。
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在二级医院住院，医疗费用可报销40%。
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在三级医院住院，医疗费用可报销30%。
- 大病补偿 ：
- 对于参加新农合的住院病人，若一次性或全年累计的医疗费用超过5000元，将分段进行赔偿。具体而言，5001元至1万元的部分可补偿65%，10001元至1.8万元的部分可补偿70%。
此外，还有一些特殊情况下的报销比例：
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门诊统筹方面，村级医院报销比例可达75%，乡级医院为65%。二级医院治疗大病，报销比例在75%至85%之间，三级医院则为55%至60%。省三级医院大病住院报销比例固定为55%。
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对于特定疾病，如儿童先心病、肺癌等，报销比例最高可达70%。
建议：
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具体报销比例可能会因地区和政策调整而有所不同，建议咨询当地医保部门或相关医疗机构以获取最准确的信息。
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大病补偿的具体政策和比例也可能因地区而异，建议详细了解当地的相关政策。