如果农村合作医疗未做参保登记，可以采取以下步骤进行处理：
- 个人自行办理 ：
- 没有工作单位的个人、自由职业者以及个体工商户，可以以灵活就业人员的身份自行办理。需要到户籍所在地的社保部门办理社保登记手续。个人只能缴纳养老和医疗两大险种。
- 通过单位缴纳 ：
- 与用人单位签订劳动合同的职工，可以通过单位缴纳社会保险。用人单位会通过代扣、代缴的方式进行缴纳。
- 及时前往当地社会保险经办机构进行登记 ：
- 对于医疗保险无登记的参保者，应及时前往当地社会保险经办机构进行登记，提交相关材料并办理参保手续。这包括提供个人身份证明、社会保险登记证等必要文件。
- 说明情况并提供证明材料 ：
- 如果因特殊原因未能及时登记参保，可以向社会保险经办机构说明情况，并提供相关证明材料。在经办机构的协助下，尽快办理参保手续，补缴欠费，以确保自己的医疗保险权益。
- 补缴欠费 ：
- 如果参保者因个人原因未能及时缴纳医疗保险费用，应尽快补缴欠费。可以向社会保险经办机构咨询具体的缴费方式和时间，以避免影响医疗保险待遇的享受。
- 线上或线下办理参保登记 ：
- 新参保、断保、新生儿缴费时显示参保信息异常或首次在庆阳市参保等人员，可以通过线上或线下多种途径先进行参保登记，再缴费。线上可以通过微信或支付宝搜索相关小程序或APP上传相关资料后进行参保登记，1个工作日后可缴费。线下可以携带相关证件至各乡镇（街道）党群服务中心、各乡镇卫生院、社区卫生服务中心、区（县）政务服务中心医保窗口，现场参保登记及缴费。
- 联系当地社保部门或医保机构 ：
- 如果系统显示参保登记信息缺失，需要尽快联系当地社保部门或医保机构，提供正确的个人信息和必要的证明文件，完成参保登记的补录或更正手续。
建议尽快办理参保登记，以确保能够顺利缴纳医保费用并享受医疗保障待遇。