新农合个人账户余额 不会 在年底清零。具体来说：
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农村医疗保险制度允许参保农民的医疗费用在本年度未用完的情况下，累积到下一年继续使用。农村医保分为门诊统筹和家庭账户两部分，家庭账户的资金可以滚动使用，不会因为年度结束而清零。
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新农合的年度结算通常在年底进行，未使用的个人账户资金可以滚存至下一年度，不会清零。
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根据《河南省医疗保障局河南省财政厅关于做好2019 年城乡居民基本医疗保障工作的通知》（豫医保办〔2019〕28 号）文件精神，自2020 年1月1 日起，不再向个人（家庭）账户分配资金，全面开展门诊统筹。原个人（家庭）账户余额不清零，可继续在乡镇卫生院（社区卫生服务中心）或村卫生室（社区卫生服务站）等基层医疗机构使用完毕为止。
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农村医保卡里的钱是个人账户的钱，一般来说只有城镇职工医保才会有个人账户。这部分钱是归属个人所有的，并且没有时间的限制。医保卡里面的钱可以累计计算，可以用来支付符合规定的医疗费用。但如中断医疗保险费用，医保卡功能会停用，但医保卡账户余额不会被清零。
综上所述，新农合个人账户余额在年底不会清零，可以累积到下一年度继续使用。建议参保农民在年度结算时妥善使用个人账户资金，以确保在下一年度能够继续享受医保待遇。