如果您在两个不同的省份都交了合作医疗，以下是处理这种情况的建议：
- 退回居民医保 ：
- 如果您在工作并参加了职工医保，且希望保留职工医保，则可以退掉明年还未生效的居民医保。但若是已经生效，那么尽管重复缴纳，费用也不会退还。
- 退回职工医保 ：
- 如果您是灵活就业人员以个人身份参加了职工医保，且一次性缴纳了一年的费用，之后找到工作，所在单位为其缴纳了职工医保，那么在这种情况下，所多交的职工医保费用是可以退回的。
- 跨省缴费方式 ：
- 您可以通过支付宝、微信、官方网站或APP、网上银行等方式进行跨省缴费。
- 集体缴费 ：
- 如果您身处外地，但户籍仍在原地，可以联系户籍所在地的村集体或村委会，询问是否可以由村集体统一收取农村合作医疗的保费，然后代为缴纳。
- 银行柜台缴费 ：
- 您可以携带身份证或户口簿、医疗保险证等证件，到指定的银行柜台进行缴费。
- 法律依据 ：
- 根据《新型农村合作医疗制度实施办法》和《国务院办公厅转发卫生部等部门关于建立新型农村合作医疗制度意见的通知》，新型农村合作医疗制度一般采取以县（市）为单位进行统筹，条件不具备的地方，在起步阶段也可采取以乡（镇）为单位进行统筹，逐步向县（市）统筹过渡。
- 重复参保处理 ：
- 农村合作医疗不允许异地交，且一个人只能办理一张社保卡。如果重复参保，必须提供参保地医保局开具的参保证明，且不能重复享受医保待遇。
综上所述，您可以选择退掉其中一个省份的居民医保，并通过线上缴费、集体缴费或银行柜台缴费等方式在另一个省份缴纳合作医疗。同时，建议您咨询当地医保部门，了解具体的退保和缴费流程。