可以，但有条件
新农合保险 可以在指定药店购买药品 ，并且可以使用医保卡内的资金进行支付。具体规定如下：
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指定药店 ：新农合药品需要在指定的药店购买，才能使用医保卡支付。不在指定药店购买的药品，医保卡不予支付。
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医保卡支付 ：在指定药店购买药品时，医保卡内的资金会直接从卡内扣除，如果卡内资金足够支付，则无需另外支付现金。
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自费药品 ：如果所购买的药品没有进入当地医保目录（即自费药品和自费诊疗项目），则不能使用医保卡支付。
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住院报销 ：新农合主要用于住院报销，不住院的情况下药品费用是无法报销的。在乡级以下的医疗单位（如乡镇卫生院、村级卫生点）看病开药可以享受报销，但有限额，一般一年各地报销金额约为两百元。
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家庭账户 ：新农合设有家庭账户，账户内的资金可以用于支付在定点医疗机构（如镇卫生院、村卫生室）的医疗费用，包括药品费用。但家庭账户的资金只能在定点医疗机构使用，不能在药店使用。
综上所述，新农合保险可以在指定药店购买药品，并且可以使用医保卡内的资金进行支付，但需注意药品必须进入医保目录，且只能在指定的医疗机构或药店使用。建议在购买药品前，先确认药品是否在医保目录内，并选择合适的医疗机构或药店进行购买。