城乡居民医疗保险和新农合的主要区别体现在以下几个方面：
- 覆盖对象 ：
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城乡居民医疗保险 ：覆盖全体城乡居民，包括城镇居民和农村居民。
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新农合 ：主要面向具有农村户籍的居民，是农民自愿参加的、以大病统筹为主的医疗互助共济制度。
- 筹资标准和经费来源 ：
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城乡居民医疗保险 ：筹资标准较高，经费来源包括个人缴纳和财政补助。
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新农合 ：缴费相对便宜，一年的缴费金额大概在两百元左右，经费来源同样由个人缴纳和财政补助。
- 补偿标准和保障待遇 ：
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城乡居民医疗保险 ：保障待遇较为全面，覆盖住院、门诊大病和普通门诊，报销比例较高，尤其在高级别医疗机构如三甲医院的报销比例一般较高。
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新农合 ：保障力度相对较低，主要侧重于住院和门诊大病，报销比例在乡镇医院较高，但在市级及以上医院的报销比例相对较低。
- 管理归属和运作机制 ：
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城乡居民医疗保险 ：主要由人力资源和社会保障部门负责管理和运作。
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新农合 ：在多数地方由卫生部门进行管理，体现了两者在行政归属和运作机制上的差异。
- 缴费方式和保障期限 ：
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城乡居民医疗保险 ：具有一定强制性，企业必须为在职职工购买，缴费年限满足后可以终身享受。
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新农合 ：根据农村实际情况自愿参加，一年一交费、一年一参合，交一年保费享受一年待遇。
综上所述，城乡居民医疗保险和新农合在覆盖对象、筹资标准、经费来源、补偿标准、管理归属和运作机制以及缴费方式和保障期限等方面存在明显差异。建议根据自身户籍和实际情况选择合适的医疗保险制度，以获得更全面和有力的医疗保障。