婴儿农村合作医疗和新农合的区别主要体现在以下几个方面：
- 投保对象 ：
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新生儿医保 ：主要针对城镇户籍的居民，并且只能在户籍当地参保，由人社部门管理。
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新农合 ：主要针对农村户籍的居民，由卫生部门管理。
- 管理部门 ：
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新生儿医保 ：由人社部门管理。
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新农合 ：由卫生部门管理。
- 报销范围及比例 ：
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新生儿医保 ：报销范围比农村合作医疗广，报销比例也较高。
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新农合 ：覆盖面广，对于成年人也是适用的，报销比例相对较低。
- 购买条件 ：
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新生儿医保 ：一般没有年龄限制，从宝宝出生后购买，需要提供一些相关材料。
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新农合 ：购买条件主要是与农村户籍或农村居住证挂钩。
- 补偿水平及保障方式 ：
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新生儿医保 ：给付水平的确定只考虑投保人缴费额的多少，主要体现货币支付的关系。
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新农合 ：更具人性化，补偿水平根据各地物价指数不同而有所差异，并且对于特困户和五保户，政府会提供一定的补助。
- 资金来源 ：
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新生儿医保 ：完全由投保人负担。
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新农合 ：由国家及地方财政、个人共同分担。
- 性质与目标取向 ：
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新农合 ：属于政府行为，体现国家的社会政策，具有非盈利性质。
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新生儿医保 ：是一种商业行为，由保险公司提供，体现的是平等自愿的契约关系。
建议
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新生儿医保 ：适合城镇户籍的家庭，能够提供较广的报销范围和较高的报销比例，建议家长在新生儿出生后尽快办理。
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新农合 ：适合农村户籍的家庭，虽然报销比例相对较低，但覆盖面广，能够有效减轻因病致贫的风险，建议农村家庭按时缴纳费用。
通过以上信息，家长可以根据自身情况选择适合的医疗保险，确保婴儿能够获得必要的医疗保障。