农村合作医疗断交后，可以通过以下几种方式在网上进行补缴：
- 通过支付宝补缴 ：
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打开支付宝软件，点击市民中心。
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进入社保选项。
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选择城乡医保缴费，进行缴费补缴。
- 通过微信补缴 ：
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打开微信，点击右下角“我”，选择“服务”。
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在服务界面中找到“城市服务”，点击进入。
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在“热门专题”中找到“社保”，点击进入。
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选择“城乡居民医保缴费”进行缴费。
- 通过当地社保APP或公众号补缴 ：
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下载并登录当地社保APP或关注官方公众号。
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在相应模块中找到“社保缴费”或“城乡居民医保缴费”选项，按照提示完成缴费。
- 通过电子社保卡补缴 ：
- 登录电子社保卡，选择社保缴费功能，按照提示完成缴费。
- 通过银行代扣方式补缴 ：
- 将保费存入指定的银行账户，由银行按月代扣。
- 通过农村商业银行代理网点补缴 ：
- 携带身份证和农村商业银行的银行卡，前往农村商业银行的代理网点，按照工作人员的指引完成缴费。
注意事项：
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补缴时间期限需要根据当地政策确定，错过集中征缴期后，可能需要全额补缴，包括政府补助部分。
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建议提前确认当地社保局或相关官方网站的补缴政策和流程，以确保能够顺利完成补缴。
通过以上几种方式，您可以方便快捷地在网上完成农村合作医疗的补缴。