交社保后不能再交农村合作医疗的原因主要是 社保（特别是其中的医疗保险部分）与农村合作医疗存在冲突 。具体来说，这两者都提供医疗保险保障，但只能选择其中一项进行报销，不能同时享受两份待遇。
详细原因如下：
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重复参保问题 ：社保和农村医疗保险都属于医疗保险范畴，根据《中华人民共和国社会保险法》的规定，一个人只能参加一份基本医疗保险，不能重复参保。如果同时缴纳社保和农村医疗保险，在出险后将无法同时享受两份报销，这显然是不合理的。
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保障范围重叠 ：社保中的医疗保险部分通常覆盖范围更广，报销比例和待遇相对更优。而农村合作医疗主要针对农村居民，保障范围和报销标准相对较低。因此，从保障的全面性和待遇的优劣势来看，社保已经足够满足大部分人的医疗需求，无需再额外购买农村医疗保险。
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避免资源浪费 ：重复缴纳医疗保险不仅会增加个人的经济负担，还会造成社会资源的浪费。社保制度设计之初就是为了通过集中资源为更多人提供更全面的保障，重复参保违背了这一初衷。
综上所述，交了社保后不能再交农村合作医疗，主要是因为这两者存在冲突，不能重复享受医疗保险待遇。建议选择其中一项保险进行参保，以充分利用社保的全面保障功能，并避免不必要的经济负担和资源浪费。