农村合作医疗在市级医院是可以报销的。根据2025年的政策，农村合作医疗的报销范围涵盖了不同级别的医疗机构，包括市级医院。具体来说：

住院报销

• 报销比例：在市级医院（通常为三级医疗机构）住院治疗时，政策范围内的报销比例一般可以达到60%。

• 起付线：市级医院的起付线通常为700元左右。

• 最高支付限额：住院医疗的最高支付限额为10万元。

报销流程

• 就医时：参保居民需携带本人身份证和新型农村合作医疗卡，在定点医疗机构办理住院手续。

• 出院时：医院会按照补偿相关规定给予实时结报。

• 市外医院：如果在市外医院就医，需要在出院后将相关材料（如新型农村合作医疗卡、身份证、转院转诊单等）交至镇乡财政所初审，再由市合管办审核结报。

注意事项

• 定点医疗机构：确保选择的市级医院是农村合作医疗的定点医疗机构，以享受报销政策。

• 报销范围：了解具体的报销范围和政策，包括哪些医疗项目和药品可以报销，哪些不可以。

• 及时报销：注意报销的时限，通常为下年度1月30日之前，逾期将不予报销。

综上所述，农村合作医疗在市级医院是可以报销的，但需要遵循相关的报销流程和政策规定。具体的报销比例和起付线可能会因地区而异，建议咨询当地的农村合作医疗管理部门或定点医疗机构，以获取最准确的信息。