全国在儿科消化科领域具有较高声誉和专业水平的医院包括：
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北京协和医院 ：作为国内顶级综合医院，拥有丰富的医疗资源和经验，是国家卫生健康委指定的疑难重症诊治指导中心。
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四川大学华西医院 ：以完善的诊疗设施和医疗人员储备著称，连续多年在**专科声誉和**医院排行榜中名列全国第二。
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北京301医院 ：中国人民解放军总医院，综合性医院，集医疗、保健、教学、科研于一体。
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上海交通大学医学院附属瑞金医院 ：在儿科消化科领域具有较高声誉。
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复旦大学附属中山医院 ：综合医院，拥有强大的医疗团队和丰富的临床经验。
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长春市儿童医院 ：设施完善，经验丰富，特别适合儿童消化不良的治疗。
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乌鲁木齐市中医医院 ：在中医药治疗老年性疾病、精神病疾病等方面有独特优势。
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河南中医药大学第一附属医院 ：以中医药治疗为特色，综合医院。
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北京中医药大学东直门医院东区 ：设有多个重点专科，包括脾胃病科，经验丰富。
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中山大学附属第六医院 ：以胃肠肛门专科为特色，综合医院。
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深圳市儿童医院 ：现代化的综合性儿童医院，专业设置齐全。
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湘潭市妇幼保健院 ：设施完善，经验丰富。
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中山市博爱医院 ：综合性医院，设有多个临床科室和医疗中心。
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重庆医科大学附属儿童医院 ：在儿科领域具有较高声誉。
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重庆三峡中心医院儿童分院 ：提供全面的儿科医疗服务。
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首都医科大学附属北京儿童医院 ：在复旦版医院专科榜中排名第2，专业水平高。
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北京大学第一医院 ：在复旦版医院专科榜中排名第6。
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首都儿科研究所附属儿童医院 ：专业水平高，口碑良好。
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乌鲁木齐儿童医院 ：拥有70年历史，专业水平高，擅长小儿消化科常见病及疑难病的诊治。
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新疆维吾尔自治区人民医院 ：综合医院，儿科由经验丰富的医师组成。
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新疆医科大学第一附属医院 ：在儿科消化科领域具有较高声誉。
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四川大学华西第二医院 ：设有小儿消化科，专业水平高。
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新华医院 ：综合医院，儿童消化科有一定声誉。
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浙江大学医学院附属儿童医院 ：在儿科领域具有较高声誉。
这些医院在儿科消化科领域均有较高的专业水平和丰富的临床经验，建议根据具体地理位置、医院特色以及个人需求选择合适的医院进行就诊。