北京协和医院普通门诊与国际医疗部的主要区别体现在以下几个方面：
- 费用方面 ：
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普通门诊的挂号费为50-100元，检查费和手术住院费均按标准收费且可报销。
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国际医疗部的挂号费为600-1200元，检查费和手术住院费均比普通门诊贵4-5倍，且不可报销。
- 服务体验 ：
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普通门诊的挂号、检查、手术等流程较为便捷，医生安排相对灵活，但每次接诊的医生不固定。
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国际医疗部提供更为高端的服务，减少排队等待时间，每次接诊的医生固定，且病房环境更为舒适，提供单间和套间选择，设施更为齐全。
- 就诊环境 ：
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普通门诊位于医院的传统区域，环境相对拥挤，但整体干净，候诊区设有孕妇专用座椅。
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国际医疗部位于单独的门诊楼，环境更为安静、干净，硬件设施先进，就诊基本需要预约，排队等待时间较短。
- 服务对象 ：
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普通门诊主要服务于国内患者。
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国际医疗部主要服务于国际患者，包括外籍人士、港澳台居民、华侨和海外华人等。
- 报销政策 ：
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普通门诊的挂号费用可以报销。
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国际医疗部的所有费用均需自费，尽管有极少数情况下报销成功一小部分，但总体费用较高。
综上所述，如果您是外籍人士、港澳台居民、华侨或海外华人，且对高端医疗服务和个性化医疗有较高需求，国际医疗部可能是更好的选择。如果您是国内患者，且希望在费用相对经济的情况下接受高质量的医疗服务，普通门诊则更为合适。