北京中医药大学最好的附属医院有以下几家：

1. 北京中医药大学东直门医院 ：这是一家老牌子的中医院，每年收治的患者人数最多，虽然内部设施有些老旧，但整体实力非常强。

2. 北京中医药大学东方医院 ：这家医院以中医底蕴深厚和卓越的医疗服务著称，是传统与现代交织的医疗圣殿。

3. 北京中医药大学第三附属医院 ：这所医院集医疗、教学、科研于一体，以高品质医疗和独特疗法探索闻名，是中医药领域的翘楚。

4. 广安门医院 ：这是中国中医科学院直属的中医医院，以针灸和肿瘤治疗著称，是全国示范中医医院。

5. 西苑医院 ：作为中研院的附属医院，以妇科治疗闻名。

6. 北京中医医院 ：这家医院是市属综合性、现代化三级甲等中医医院，承担着北京市中医医疗、教学、科研、预防等任务，并且是首都医科大学中医药临床医学院和北京中医药大学的教学医院。

建议 ：

• 东直门医院 ：适合需要传统中医治疗和丰富临床经验的患者。

• 东方医院 ：适合追求现代医疗技术和中医结合的患者。

• 第三附属医院 ：适合需要高品质医疗和独特疗法的患者。

• 广安门医院 ：适合需要针灸和肿瘤治疗的患者。

• 西苑医院 ：适合需要妇科治疗的患者。

• 北京中医医院 ：适合需要综合性中医治疗和现代医疗设施的患者。

根据具体病情和需求选择最适合的医院。