小脑萎缩的原因有多种多样，主要分为原发性和继发性。
一、原发性小脑萎缩主要见于遗传性疾病，如脊髓小脑性共济失调，慢性退行性病变，如多系统萎缩，还可能因年龄的增长而导致小脑萎缩。
二、导致继发性小脑萎缩的原因有小脑血管病变、慢性酒精中毒性疾病、小脑炎症、药物中毒等。
其中以小脑血管疾病最常见，反复的脑梗死或脑出血可以造成小脑脑细胞严重脱失，而从生理上表现为小脑体积减小，造成小脑萎缩的相应症状。
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